Bioinformàtic/a

Context

El Barcelonaβeta Brain Research Center (BBRC) és un centre de recerca dedicat a la prevenció de la malaltia d’Alzheimer i a l’estudi de les funcions cognitives afectades en l’envelliment, tant saludable com patològic. Va ser creat l’any 2012 per la Fundació Pasqual Maragall, amb el suport de la Universitat Pompeu Fabra.

La missió del BBRC és oferir solucions innovadores per descriure i prevenir els canvis biològics i les disfuncions cognitives associades a les malalties neurodegeneratives. L’envelliment de la població mundial converteix aquestes malalties en un repte global, ja que, per exemple, la demència podria assolir nivells epidèmics l’any 2050, amb una previsió de més de 150 milions de persones afectades si no es troba una manera eficaç de prevenir-ne l’aparició i el desenvolupament.

El BBRC ha rebut el segell HR Excellence in Research (HRS4R) atorgat per la Comissió Europea, un reconeixement que acredita el seu compromís amb els principis de la Carta Europea del Personal Investigador i el Codi de Conducta per a la Contractació de Personal Investigador. El centre ofereix un entorn de treball estimulant i favorable, d’acord amb aquests principis, que descriuen els drets i responsabilitats dels investigadors i dels seus ocupadors, i que contribueixen a crear un ecosistema transparent, atractiu i obert a escala internacional.

La Fundació Pasqual Maragall, la Universitat Pompeu Fabra i la Fundació “la Caixa” són membres permanents del Patronat del BBRC. El centre està adscrit a la Universitat Pompeu Fabra i ubicat al Campus de la Ciutadella de Barcelona, en un edifici inaugurat el 2016. La seva seu compta amb excel·lents instal·lacions tècniques, incloent-hi un escàner 3TMR dedicat a la recerca, així com espais per a assajos clínics i EEG. Les infraestructures científiques d’avantguarda, una gestió eficient i una avaluació contínua d’alt nivell són els pilars del BBRC per garantir resultats científics d’abast internacional.

El BBRC forma part també del Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (PRBB), un gran complex de recerca que acull set institucions més dedicades a la recerca biomèdica, com el Centre de Regulació Genòmica (CRG), l’Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (IMIM), el Departament de Ciències Experimentals i de la Salut de la UPF (CEXS-UPF), l’Institut de Biologia Evolutiva (IBE CSIC-UPF), l’Institut de Salut Global de Barcelona (ISGlobal) i la seu de Barcelona del Laboratori Europeu de Biologia Molecular (EMBL), entre d’altres. Aquest entorn multidisciplinari, col·laboratiu i internacional, en estreta connexió amb l’àmbit clínic, afavoreix una recerca translacional d’excel·lència.

Per a més informació, visiteu les nostres pàgines web: www.fpmaragall.org i www.barcelonabeta.org

Sobre la posició

Busquem un/a Bioinformàtic/a amb una sòlida experiència en la gestió, anàlisi i explotació de dades biomèdiques i òmiques per incorporar-se al nostre equip del DataCenter. La persona seleccionada serà responsable de la gestió de pipelines de dades, el processament de datasets massius i el desenvolupament de solucions per integrar IA i anàlisi bioinformàtica.

El BBRC és un centre de referència en l’estudi de l’Alzheimer, especialment en les seves fases més primerenques. La cohort ALFA disposa de dades clíniques, cognitives, genètiques, de neuroimatge, biomarcadors i proteòmica de participants seguits longitudinalment.

Principals responsabilitats

• Desenvolupar i mantenir pipelines bioinformàtics per al processament de dades genòmiques, transcriptòmiques, proteòmiques, epigenòmiques, etc.
• Realitzar anàlisis bioinformàtiques exploratòries i avançades per donar suport als projectes de recerca.
• Col·laborar amb bioestadístics i científics de dades en la generació de models predictius i el descobriment de biomarcadors.
• Integrar diferents fonts de dades biomèdiques a la plataforma (dades clíniques, òmiques, imatge, biomarcadors).
• Participar en la implementació d’estàndards d’interoperabilitat i qualitat de dades (principis FAIR).
• Documentar i comunicar procediments, resultats i eines desenvolupades.
• Donar suport en el desenvolupament d’aplicacions d’intel·ligència artificial aplicades a la bioinformàtica.
• Organitzar seminaris i tallers pràctics de bioestadística adreçats a estudiants de doctorat, postdocs i altres investigadors.

El/la bioinformàtic/a tindrà l’oportunitat de participar com a autor/a en estudis del BBRC, sota la supervisió d’un/a investigador/a principal.

Requisits

• Grau i/o Màster en Bioinformàtica, Ciències de la Computació, Biologia Computacional o camps relacionats.
• Experiència mínima de 3 anys en projectes d’anàlisi de dades biomèdiques o recerca bioinformàtica.
• Domini de Python, R i Bash.
• Experiència amb eines de bioinformàtica com Nextflow, Snakemake, GATK, Bioconductor, entre d’altres.
• Coneixement de bases de dades biomèdiques (Ensembl, GEO, dbGaP, TCGA, etc.).
• Capacitat per treballar en entorns Linux/Unix i gestionar dades en entorns de computació d’alt rendiment (HPC).
• Actitud proactiva i col·laborativa, bones habilitats de comunicació i atenció al detall.

Es valorarà positivament

• Experiència en IA aplicada a la bioinformàtica (Deep Learning, anàlisi d’imatge, etc.).
• Coneixements d’estadística aplicada o anàlisi de dades clíniques.
• Experiència en el desenvolupament de solucions interoperables i APIs per a plataformes de dades.
• Publicacions científiques en revistes internacionals.

Habilitats personals

• Habilitats de comunicació.
• Capacitat per treballar de manera autònoma i en col·laboració amb l’equip.
• Capacitat d’organització.
• Proactivitat.
• Habilitats interpersonals per treballar en un entorn interdisciplinari.
• Capacitat per resoldre problemes i assolir objectius.
• Interès per formar part d’una organització sense ànim de lucre amb una missió d’alt impacte social.

Característiques de la posició

• Data d’inici: immediata.
• Contracte indefinit
• Jornada completa, 38 hores setmanals.
• El salari dependrà de l’experiència aportada i s’ajustarà a la política retributiva i al Pla de Desenvolupament del BBRC.
• Pla de retribució flexible (targeta de menjador, assegurança mèdica, guarderia).
• Vacances: 23 dies laborables anuals, proporcionals a la data de contractació. Addicionalment, el centre ofereix dies extres coincidents amb ponts i períodes dels mesos de març-abril i desembre.
• Oferim un entorn de treball altament estimulant, amb infraestructures i oportunitats úniques de desenvolupament professional.

Per postular

 Cal enviar un únic fitxer PDF que inclogui:

• Carta de motivació: destacant els interessos, l’experiència i la motivació per unir-se a la missió de la Fundació.

• Currículum vitae actualitzat.

• Referències: es podran sol·licitar els noms i dades de contacte de fins a tres referències a mesura que avanci el procés de selecció.

Tota la documentació s’ha d’enviar de manera confidencial i electrònica a talent@barcelonabeta.org, indicant a l’assumpte: Bioinformàtic/a

En compliment de la normativa de protecció de dades, us informem que les vostres dades personals seran tractades per la Fundació Pasqual Maragall per gestionar el procés de selecció de la posició a la qual heu aplicat.

Podeu exercir els vostres drets d’accés, rectificació, supressió, oposició i altres drets reconeguts per la normativa enviant un correu electrònic a gdpr@barcelonabeta.org i consultar la política completa de protecció de dades a la nostra web.